Cikal bakalnya adalah terbentuknya Kepanduan "Bintang Islam" oleh KH. Arif Siraj Lc, dengan menu latihan antara lain : ketrampilan kepramukaan, latihan seni, penjelajahan, pertanian, peternakan, kepemimpinan dan lain sebagainya. Bahkan waktu-waktu liburan pun dimanfaatkan untuk kegiatan perkemahan di sekitar kampus di bawah pengawasan langsung KH. Arif Siraj Lc.
Sekarang, kegiatan kepramukaan di Istiqamah ditangani oleh Koordinator Kepramukaan Pondok Modern Al-Istiqomah di bawah bimbingan dan pengawasan Majelis Pembimbing Koordinator Harian (Mabikori). Berikut ini gambaran kegiatan selama satu tahun.
Rapat Kerja Koordinator
Sebagai bukti bahwa Gerakan Pramuka di Istiqamah merupakan wadah pendidikan berorganisasi bagi para santri, diselenggarakanlah Rapat Kerja Koordinator (Rakoord) yang agendanya adalah membahas program kerja Koordinator untuk kurun waktu satu tahun mendatang. Kegiatan ini diikuti oleh semua siswa kelas V baik sebagai pengurus Koordinator maupun pembantu pembina. Rapat ini terdiri dari tiga persidangan: Sidang Pleno, Sidang Komis, dan Sidang Paripurna di bawah bimbingan Mabikori, Mabigus, dan staf pengasuhan santri, masing-masing selaku steering Committee.
Mugus
Dalam rangka mengevaluasi program lama dan menyusun program baru sekaligus mengesahkannya, setiap Gudep mengadakan Musyawarah Gugus Depan (Mugus) sekali setahun. Musyawarah yang disusul dengan pergantian Pembina Gugus Depan (Bindep), diikuti oleh seluruh pembantu pembina, andika laksana II, pemimpin sangga, pemimpin regu, dan Mabigus. Dalam acara musyawarah ini Bindep lama membacakan laporan pertang-gungjawaban dilanjutkan dengan serah terima amanat, pem-bahasan program kerja baru untuk masa satu tahun yang akan datang, dan pengesahannya.
Kursus-Kursus
Dalam upaya meningkatkan kualitas pembina dan peserta didik pramuka, diadakanlah berbagai kursus, antara lain.
- KMD
Dalam upaya mening-katkan mutu pembina maka Gerakan Pramuka Kepramukaan mengadakan Kursus Pembina Pramuka Mahir Tingkat Dasar yang disebut juga Kursus Mahir Dasar (KMD)
- MPP
- KML
- LP3 Antar Pondok Alumni
Kegiatan ini di samping bertujuan mempererat tali silaturrahim antar santri Istiqamah dan Pondok-pondok Alumni juga bertujuan mengenalkan kepada santri baru tentang kegiatan kepramukaan di Pondok Modern.
- Perkajum
- Latihan Search And Rescue (SAR)
- Mengirim Kontingen ke Jamnas
- Pramuka Garuda
- Pelatihan Pengembangan Kepemimpinan
- Laporan Pertanggungjawaban dan Pengukuhan Andalan Koordinator dan Bindep
- Pramuka Kepanduan*Istiqamah..
Sebelum dilaksanakan pengukuhan pengurus lama terlebih dahulu melaporkan kegiatan selama masa baktinya, kemudian dilanjutkan dengan pengukuhan serta pelantikan pengurus baru.
- Kegiatan Lain dalam Kampus
- Praktek Pengayaan Lapangan (PPL), untuk andika Laksana II dari kelas III Int. dan Kelas IV.
- Perlombaan Insidentil antar pembantu pembina.
- Penjelajahan kesekitar kampus Istiqomah.
- Latihan panjat tebing bagi staf Koordinator, andika, anggota DKK, dan asisten Andalan Koordinator Urusan Kesekretariatan.